近亲结婚会增加后代患隐性遗传病的风险，核心原因与基因传递规律有关：
 
  隐性致病基因的“相遇”概率更高：每个人都可能携带一些隐性致病基因（如白化病、苯丙酮尿症等的致病基因），但因为是隐性，只要不是成对存在（即只有一个致病基因），就不会发病。
   近亲基因相似度高：近亲（如直系血亲、三代以内旁系血亲）来自共同的祖先，携带相同隐性致病基因的概率比非近亲高得多。当两人结婚时，双方传递相同隐性致病基因给后代的可能性大大增加，导致后代“成对”携带致病基因，从而表现出遗传病。
 
比如，假设一种隐性遗传病的致病基因在人群中携带率是1/50，非近亲结婚时，后代患病概率约1/10000；而近亲结婚时，这个概率可能升高到1/100甚至更高（具体因近亲程度而异）。这就是我国法律禁止近亲结婚的重要科学依据。